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which() の戻り値と論理ベクトルによる添字指定を混同するとずれる

which(条件)は条件を満たす要素の「位置（添字番号）」を返しますが、条件そのもの（論理ベクトル）を直接添字として使うのとは意味が違います。

 1  scores <- c(45, NA, 91, 33, 76)
 2  passed <- scores[___________________]
                              ^
 3  cat(passed, "\n")